脊柱外科
长链非编码RNA在人退变椎间盘组织中的基因表达谱
中华医学杂志, 2017,97(33) : 2582-2586. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2017.33.006
摘要
目的

探讨长链非编码RNA(lncRNA)在椎间盘退变(IDD)的表达情况。

方法

应用人髓核(NP)组织的lncRNA-mRNA芯片。采用生物信息学方法来预测描绘差异性表达的lncRNA的功能及作用。并选择部分lncRNAs和mRNA用于定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)验证。

结果

在退变椎间盘组织中有差异性表达的总共1 570个lncRNA。其中,428个lncRNA的表达水平与正常椎间盘组织相比上调>2倍,而584个的表达水平下调。生物信息学分析(GO分析和KEGG生物学通路分析)显示,参与调节细胞外基质和凋亡的一些典型途径在这些细胞中异常表达(P<0.05)。分析增强子样的lncRNA及其附近的编码基因,确定3个lncRNAs为潜在的增强剂。RT-qPCR在退变髓核组织中验证了lncRNA的存在。

结论

lncRNAs参与椎间盘退变的进展。LncRNA可能是新的候选生物标志物和椎间盘退变潜在的治疗靶标。

引用本文: 孙中仪, 晏鹏, 王圣杰, 等.  长链非编码RNA在人退变椎间盘组织中的基因表达谱 [J]. 中华医学杂志,2017,97( 33 ): 2582-2586. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2017.33.006
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下腰痛严重影响人的生活质量并产生严重的社会经济负担[1]。下腰痛的主要原因是椎间盘退化(IDD)。研究表明,IDD的发生、发展过程中,涉及细胞的各个方面失调[2]。在这些改变的基础上存在特定分子基因表达的失调。大规模基因表达研究揭示,大量的编码基因在IDD中异常表达,其中部分编码基因这被证明在IDD中扮演重要角色[3];几种调节因子在不同层次的改变导致上述基因失调[4]。非编码RNA是不同组的哺乳动物基因组的转录输出,但是没有蛋白质编码功能。越来越多的证据表明非编码RNA参与协调基因表达的众多过程[5]。主要分为短链非编码RNA和长链非编码RNA(lncRNA)。lncRNA被证实在人类生物学方面发挥作用[6]。lncRNA表达失衡及突变与一系列人类疾病密切相关,包括神经变性和癌症[7]。然而,尚未见lncRNAs在IDD中表达谱的研究。本研究进行lncRNA-mRNA微阵列分析以鉴定IDD中髓核(NP)中lncRNA的表达谱,同时运用一系列生物信息学方法预测差异表达的lncRNA的功能。

 
 
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椎间盘
髓核细胞
基因表达
细胞衰老